新墨西哥大学医学院外科学系提供全方位的学术医学课程，分为九个临床部门：
急性护理外科部门为儿童和成人提供最高水平的创伤护理，因为他们是整个新墨西哥州唯一经过验证的 1 级创伤中心。 教师致力于通过接受最好的继续教育来满足社区的需求，以不断提供特殊的照顾。
普通和胃肠外科部门提供先进的患者护理，同时在该领域进行创新研究，并通过我们的住院医师计划培训下一个时代的外科医生。
小儿外科以富有同情心、以家庭为中心的护理服务，照顾从新生儿到青春期的儿童。
外科肿瘤学部为乳腺、胃、胰腺和肝脏以及黑色素瘤提供全面的癌症护理，并提供外科肿瘤学奖学金，以推进该领域的培训。
血管外科事业部致力于改善动静脉疾病患者的生活，同时培养下一代血管外科医生。
心胸外科部门的成人和小儿心脏和胸部护理可治疗所有心脏和肺部疾病，包括该地区其他地方无法进行的复杂手术。
耳鼻喉科 - 头颈外科治疗耳、鼻、喉、头和颈部的复杂疾病。 我们的住院医师计划为未来的外科医生做好准备，以进一步推进 ENY 医学和研究。
整形与重建外科部门为烧伤、重建和整容手术提供专家护理和培训。 我们还提供塑料、烧伤和手部的实习机会。
新墨西哥大学医学院外科系泌尿科为男性和女性泌尿外科疾病提供微创腹腔镜手术和其他干预措施。
