基因组侦探

UNM 科学家研究冠状病毒的变异，以寻找接下来会发生什么的线索

作为新型冠状病毒 - 科学家称为 SARS-CoV-2 - 繁殖，其遗传密码出现变异。 随着时间的推移，这些变化就像指纹一样，留下了关于病毒去过哪里以及可能会去哪里的线索。

新墨西哥大学的科学家 Darrell L. Dinwiddie 博士和 Daryl Domman 博士是 扮演基因组侦探的角色，试图破案。

他们是新成立的全国研究型大学和公共卫生部门联盟的一部分，旨在追踪这种疾病。 该计划被称为 SARS-CoV-2 SPHERES，由国家新发和人畜共患传染病中心（疾病控制和预防中心的一个分支机构）赞助，作为汇集有关该病毒的重要信息的一种方式。

过去几周，UNM 儿科系助理教授 Dinwiddie 一直在他的分子基因组学实验室对从新墨西哥州卫生部和怀俄明州公共卫生实验室获得的数百个冠状病毒样本进行测序。

“我们最近完成了来自新墨西哥州的前 48 个基因组，”他说。 “有强有力的迹象表明，该州的大多数首次感染病例都与来自世界各地的旅行有关。”

Dinwiddie 一直在与内科助理教授 Domman 博士合作进行分析。 “他做了很多我们称之为基因组流行病学的工作，”Dinwiddie 说，并补充说 Doman 有应对全球霍乱爆发的经验。 “我们正在使用非常相似的方法来调查 SARS-CoV-2。”

新型冠状病毒基因组由一种称为 RNA 的分子链编码。 链中核苷酸序列的微小变化提供了关于一个病毒样本与另一个病毒样本的关联程度的信息。

像 Dinwiddie 和 Domman 这样的科学家正在努力建立这些样本的图书馆，以创建病毒系谱。

对在新墨西哥州收集的样本进行的初步分析表明，该病毒多次传入该州，这与在国外或国内旅行的人中的早期病例报告一致。

“我们还可以说，从早期的基因组分析来看，大多数样本与来自欧洲或纽约的菌株更相似，”他说。 “我们没有看到很多与中国密切相关的人。”

病毒繁殖的基因组变异是一个自然过程。 “对于 SARS-CoV-2 S，基因组变化的速度相当稳定，”丁威迪说。 “我们知道它变化的速度有多快。根据这些信息，我们可以预测不同样本已经过去了多远。”

病毒样本取自从冠状病毒感染检测呈阳性的患者身上收集的鼻拭子。 Dinwiddie 说，它们使用生物安全程序进行处理并灭活，因此它们不再具有传染性。